MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori Shi112 chromosome

Total Repeats: 34713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017741	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	386753520
2	NC_017741	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	386753520
3	NC_017741	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753520
4	NC_017741	T	6	6	259	264	0 %	100 %	0 %	0 %	386753520
5	NC_017741	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753520
6	NC_017741	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	386753520
7	NC_017741	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	386753520
8	NC_017741	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753520
9	NC_017741	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386753520
10	NC_017741	ACC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386753520
11	NC_017741	C	6	6	400	405	0 %	0 %	0 %	100 %	386753520
12	NC_017741	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386753521
13	NC_017741	GCATT	2	10	584	593	20 %	40 %	20 %	20 %	386753521
14	NC_017741	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	386753521
15	NC_017741	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386753521
16	NC_017741	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386753521
17	NC_017741	CT	3	6	703	708	0 %	50 %	0 %	50 %	386753521
18	NC_017741	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753521
19	NC_017741	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	386753521
20	NC_017741	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753521
21	NC_017741	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	386753522
22	NC_017741	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753522
23	NC_017741	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386753522
24	NC_017741	CCG	4	12	1043	1054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386753522
25	NC_017741	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386753522
26	NC_017741	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386753522
27	NC_017741	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	386753522
28	NC_017741	T	6	6	1243	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	386753522
29	NC_017741	CTA	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753522
30	NC_017741	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	386753522
31	NC_017741	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	386753522
32	NC_017741	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386753522
33	NC_017741	GCTT	2	8	1455	1462	0 %	50 %	25 %	25 %	386753522
34	NC_017741	CT	3	6	1561	1566	0 %	50 %	0 %	50 %	386753522
35	NC_017741	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	386753522
36	NC_017741	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753522
37	NC_017741	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753522
38	NC_017741	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753522
39	NC_017741	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753523
40	NC_017741	A	7	7	1777	1783	100 %	0 %	0 %	0 %	386753523
41	NC_017741	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	386753523
42	NC_017741	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	386753523
43	NC_017741	ATG	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753523
44	NC_017741	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	386753523
45	NC_017741	TCA	2	6	1860	1865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753523
46	NC_017741	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	386753523
47	NC_017741	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753523
48	NC_017741	CTG	2	6	1958	1963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386753523
49	NC_017741	T	6	6	1976	1981	0 %	100 %	0 %	0 %	386753523
50	NC_017741	CTT	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753523
51	NC_017741	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386753523
52	NC_017741	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753523
53	NC_017741	AATG	2	8	2064	2071	50 %	25 %	25 %	0 %	386753523
54	NC_017741	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386753523
55	NC_017741	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753523
56	NC_017741	AGG	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386753523
57	NC_017741	GATTA	2	10	2248	2257	40 %	40 %	20 %	0 %	386753523
58	NC_017741	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	386753523
59	NC_017741	A	8	8	2541	2548	100 %	0 %	0 %	0 %	386753524
60	NC_017741	TCTT	2	8	2557	2564	0 %	75 %	0 %	25 %	386753524
61	NC_017741	T	7	7	2637	2643	0 %	100 %	0 %	0 %	386753524
62	NC_017741	T	7	7	2679	2685	0 %	100 %	0 %	0 %	386753524
63	NC_017741	AGC	2	6	2777	2782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386753524
64	NC_017741	GC	3	6	2790	2795	0 %	0 %	50 %	50 %	386753524
65	NC_017741	A	6	6	2828	2833	100 %	0 %	0 %	0 %	386753524
66	NC_017741	AG	3	6	2947	2952	50 %	0 %	50 %	0 %	386753524
67	NC_017741	GTG	2	6	2966	2971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386753524
68	NC_017741	AGA	2	6	3064	3069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753524
69	NC_017741	CAAA	2	8	3100	3107	75 %	0 %	0 %	25 %	386753524
70	NC_017741	GTG	2	6	3125	3130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386753524
71	NC_017741	GCC	2	6	3132	3137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386753524
72	NC_017741	GAAA	2	8	3247	3254	75 %	0 %	25 %	0 %	386753525
73	NC_017741	GAAA	2	8	3322	3329	75 %	0 %	25 %	0 %	386753525
74	NC_017741	AGTG	2	8	3343	3350	25 %	25 %	50 %	0 %	386753525
75	NC_017741	TG	3	6	3429	3434	0 %	50 %	50 %	0 %	386753525
76	NC_017741	GTT	2	6	3578	3583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753525
77	NC_017741	ATC	2	6	3662	3667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753525
78	NC_017741	GCGATA	2	12	3726	3737	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386753525
79	NC_017741	CAAG	2	8	3823	3830	50 %	0 %	25 %	25 %	386753525
80	NC_017741	A	6	6	3866	3871	100 %	0 %	0 %	0 %	386753525
81	NC_017741	ATT	2	6	3906	3911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386753525
82	NC_017741	GGC	2	6	3979	3984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386753525
83	NC_017741	GGT	2	6	4085	4090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017741	TAT	2	6	4133	4138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017741	TGG	2	6	4177	4182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017741	ATGC	2	8	4281	4288	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017741	TGG	2	6	4297	4302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017741	GTG	2	6	4413	4418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017741	ACC	2	6	4445	4450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017741	GGT	2	6	4458	4463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017741	A	7	7	4579	4585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017741	T	8	8	4599	4606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017741	AAT	2	6	4620	4625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017741	GAAAC	2	10	4649	4658	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017741	TAAA	2	8	4689	4696	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017741	A	6	6	4694	4699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017741	ATT	2	6	4814	4819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017741	T	7	7	4832	4838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017741	A	6	6	4843	4848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017741	A	6	6	4859	4864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017741	TGT	2	6	4898	4903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017741	TTTTA	2	10	4922	4931	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017741	TC	3	6	4967	4972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017741	A	8	8	4999	5006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017741	A	6	6	5015	5020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017741	T	7	7	5216	5222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017741	CATT	2	8	5282	5289	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017741	ATT	2	6	5304	5309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017741	TGG	2	6	5402	5407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017741	A	6	6	5514	5519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017741	C	6	6	5534	5539	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
112	NC_017741	A	6	6	5556	5561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017741	GTT	2	6	5604	5609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017741	TAA	2	6	5673	5678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017741	TTA	2	6	5731	5736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017741	GTG	2	6	5800	5805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017741	GTT	2	6	5820	5825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017741	GTGC	2	8	5860	5867	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017741	TCT	2	6	5944	5949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017741	C	6	6	5966	5971	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
121	NC_017741	ATG	2	6	6020	6025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017741	AGT	2	6	6029	6034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017741	AGA	2	6	6150	6155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017741	AC	3	6	6280	6285	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017741	TTGT	2	8	6331	6338	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017741	CTT	2	6	6387	6392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017741	TAG	4	12	6414	6425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017741	TGT	2	6	6448	6453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017741	GTT	2	6	6481	6486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017741	TTG	2	6	6514	6519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017741	TGGT	2	8	6631	6638	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017741	ATCG	2	8	6805	6812	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017741	GTT	2	6	6832	6837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017741	CGTT	2	8	6840	6847	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017741	A	6	6	6979	6984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017741	GA	7	14	7013	7026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017741	T	7	7	7036	7042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017741	T	6	6	7047	7052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017741	TAAAT	2	10	7059	7068	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017741	TGT	2	6	7169	7174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017741	A	12	12	7178	7189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017741	T	6	6	7192	7197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017741	TGT	2	6	7256	7261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017741	CAT	2	6	7345	7350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753526
145	NC_017741	TCT	2	6	7412	7417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753526
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